Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TULP4Q9NRJ4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TULP4Q9NRJ4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms