Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CD163L1Q9NR16 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms