Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPHNQ9NQX3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPHNQ9NQX3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms