Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TUFT1Q9NNX1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TUFT1Q9NNX1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms