Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KIAA1549Q9HCM3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms