Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNRC6CQ9HCJ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNRC6CQ9HCJ0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNRC6CQ9HCJ0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms