Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SUDS3Q9H7L9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SUDS3Q9H7L9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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