Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TDRD3Q9H7E2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms