Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SEMA6BQ9H3T3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEMA6BQ9H3T3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms