Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP6Q9GZR1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP6Q9GZR1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms