Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BHLHE41Q9C0J9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BHLHE41Q9C0J9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms