Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CEP44Q9C0F1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms