Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXQ1Q9C009 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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