Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PUS3Q9BZE2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PUS3Q9BZE2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms