Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VN1R3Q9BXE9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms