Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3Q9BWW4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP3Q9BWW4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms