Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAGR1Q9BTK6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAGR1Q9BTK6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms