Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BPIFA3Q9BQP9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms