Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LPIN3Q9BQK8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms