Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SGIP1Q9BQI5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGIP1Q9BQI5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms