Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAD9AQ99638 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RAD9AQ99638 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms