Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARXQ96QS3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARXQ96QS3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms