Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC38A2Q96QD8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC38A2Q96QD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms