Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RDH12Q96NR8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms