Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCMTD1Q96MG8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCMTD1Q96MG8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms