Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FGD4Q96M96 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGD4Q96M96 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms