Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
LINC00208Q96KT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms