Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHACTR3Q96KR7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR3Q96KR7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms