Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC136Q96JN2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC136Q96JN2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms