Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CELF6Q96J87 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms