Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TPD52L3Q96J77 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms