Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM17Q96I25 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM17Q96I25 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
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