Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RFT1Q96AA3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms