Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC47Q96A33 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms