Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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