Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP2A3Q93084 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP2A3Q93084 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms