Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYL5

SSH1, Protein phosphatase Slingshot homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH1Q8WYL5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SSH1Q8WYL5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SSH1Q8WYL5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms