Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms