Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SSH3Q8TE77 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSH3Q8TE77 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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