Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYRIPQ8NFW9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms