Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF548Q8NEK5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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