Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EHBP1Q8NDI1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EHBP1Q8NDI1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms