Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINC00301Q8NCQ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LINC00301Q8NCQ3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms