Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APCDD1LQ8NCL9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APCDD1LQ8NCL9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms