Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6K7

SAMD3, Sterile alpha motif domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD3Q8N6K7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD3Q8N6K7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD3Q8N6K7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms