Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms