Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
VWDEQ8N2E2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
VWDEQ8N2E2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms