Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMTR1Q8N1G2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms