Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMNTD2Q8IXW0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms