Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC83Q8IWF9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms